Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PBRM1Q86U86 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PBRM1Q86U86 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms