Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDXQ7Z353 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms