Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUFY3Q7L099 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUFY3Q7L099 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RUFY3Q7L099 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUFY3Q7L099 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUFY3Q7L099 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RUFY3Q7L099 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUFY3Q7L099 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUFY3Q7L099 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RUFY3Q7L099 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUFY3Q7L099 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUFY3Q7L099 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUFY3Q7L099 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUFY3Q7L099 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUFY3Q7L099 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUFY3Q7L099 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUFY3Q7L099 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUFY3Q7L099 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUFY3Q7L099 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUFY3Q7L099 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUFY3Q7L099 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUFY3Q7L099 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUFY3Q7L099 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUFY3Q7L099 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RUFY3Q7L099 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUFY3Q7L099 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms