Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms