Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRAMD4Q6IC98 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms