Protein–RNA interactions for Protein: Q5BLP8

C4orf48, Neuropeptide-like protein C4orf48, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48Q5BLP8 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 TMEM161B-AS1-207ENST00000506584 717 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 RPS23-205ENST00000510019 1019 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 OR9G3P-201ENST00000525553 918 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 LINC01917-201ENST00000565170 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 AC097376.2-203ENST00000608663 431 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 CDV3-209ENST00000515421 1305 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 OR52B5P-203ENST00000641694 1313 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 DDX6P2-201ENST00000619520 1455 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 AC023830.2-201ENST00000563704 1662 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 DCUN1D3-202ENST00000563934 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 CCL1-201ENST00000225842 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 GNAS-209ENST00000371081 730 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 AC243547.1-201ENST00000415065 408 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 AC008443.1-204ENST00000417281 629 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 AL121972.2-202ENST00000429386 586 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 AC008799.2-201ENST00000484429 647 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 QTRT2-215ENST00000493014 1046 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C4orf48Q5BLP8 FAM76A-207ENST00000530324 1027 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms