Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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