Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms