Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
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CTF1Q16619 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CTF1Q16619 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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CTF1Q16619 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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CTF1Q16619 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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CTF1Q16619 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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CTF1Q16619 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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CTF1Q16619 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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CTF1Q16619 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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CTF1Q16619 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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CTF1Q16619 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
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