Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACKR1Q16570 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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