Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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SNAPC1Q16533 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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SNAPC1Q16533 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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SNAPC1Q16533 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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SNAPC1Q16533 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNAPC1Q16533 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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