Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPE65Q16518 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms