Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CST6Q15828 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CST6Q15828 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CST6Q15828 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CST6Q15828 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CST6Q15828 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CST6Q15828 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CST6Q15828 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CST6Q15828 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CST6Q15828 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CST6Q15828 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CST6Q15828 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CST6Q15828 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CST6Q15828 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CST6Q15828 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CST6Q15828 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CST6Q15828 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CST6Q15828 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CST6Q15828 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CST6Q15828 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CST6Q15828 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CST6Q15828 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CST6Q15828 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CST6Q15828 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CST6Q15828 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CST6Q15828 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CST6Q15828 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CST6Q15828 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CST6Q15828 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CST6Q15828 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CST6Q15828 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CST6Q15828 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CST6Q15828 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CST6Q15828 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CST6Q15828 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CST6Q15828 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CST6Q15828 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CST6Q15828 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CST6Q15828 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CST6Q15828 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CST6Q15828 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CST6Q15828 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CST6Q15828 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CST6Q15828 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CST6Q15828 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CST6Q15828 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CST6Q15828 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CST6Q15828 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CST6Q15828 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CST6Q15828 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CST6Q15828 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CST6Q15828 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CST6Q15828 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CST6Q15828 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CST6Q15828 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
CST6Q15828 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CST6Q15828 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CST6Q15828 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CST6Q15828 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CST6Q15828 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CST6Q15828 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CST6Q15828 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CST6Q15828 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CST6Q15828 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CST6Q15828 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CST6Q15828 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CST6Q15828 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CST6Q15828 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CST6Q15828 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CST6Q15828 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CST6Q15828 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CST6Q15828 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CST6Q15828 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CST6Q15828 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CST6Q15828 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CST6Q15828 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CST6Q15828 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CST6Q15828 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CST6Q15828 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CST6Q15828 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CST6Q15828 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CST6Q15828 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CST6Q15828 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CST6Q15828 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CST6Q15828 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CST6Q15828 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CST6Q15828 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CST6Q15828 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CST6Q15828 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CST6Q15828 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CST6Q15828 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CST6Q15828 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CST6Q15828 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CST6Q15828 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CST6Q15828 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CST6Q15828 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CST6Q15828 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CST6Q15828 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CST6Q15828 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CST6Q15828 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms