Protein–RNA interactions for Protein: Q15772

SPEG, Striated muscle preferentially expressed protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 3,267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEGQ15772 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPEGQ15772 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms