Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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CDSNQ15517 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CDSNQ15517 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CDSNQ15517 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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CDSNQ15517 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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CDSNQ15517 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CDSNQ15517 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CDSNQ15517 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CDSNQ15517 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CDSNQ15517 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CDSNQ15517 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CDSNQ15517 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CDSNQ15517 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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