Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC006547.1-209ENST00000596334 996 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
RYR3Q15413 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms