Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TLR1Q15399 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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TLR1Q15399 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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TLR1Q15399 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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