Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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PDCD1Q15116 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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PDCD1Q15116 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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PDCD1Q15116 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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PDCD1Q15116 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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PDCD1Q15116 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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PDCD1Q15116 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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PDCD1Q15116 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDCD1Q15116 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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