Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 LRRIQ3-202ENST00000370909 793 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 AC022148.2-201ENST00000586176 560 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LAPTM4AQ15012 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LAPTM4AQ15012 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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