Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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GBX1Q14549 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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GBX1Q14549 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GBX1Q14549 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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