Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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COL4A6Q14031 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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COL4A6Q14031 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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COL4A6Q14031 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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COL4A6Q14031 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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COL4A6Q14031 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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COL4A6Q14031 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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