Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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