Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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