Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
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