Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ATRQ13535 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ATRQ13535 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRQ13535 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRQ13535 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRQ13535 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRQ13535 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRQ13535 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRQ13535 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRQ13535 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRQ13535 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRQ13535 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRQ13535 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRQ13535 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRQ13535 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRQ13535 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRQ13535 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRQ13535 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRQ13535 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRQ13535 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRQ13535 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRQ13535 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRQ13535 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRQ13535 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRQ13535 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRQ13535 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRQ13535 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRQ13535 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRQ13535 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRQ13535 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRQ13535 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRQ13535 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRQ13535 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRQ13535 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRQ13535 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRQ13535 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRQ13535 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRQ13535 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ATRQ13535 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms