Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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