Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTGDRQ13258 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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