Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GRIK3Q13003 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GRIK3Q13003 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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