Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms