Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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FOXF2Q12947 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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FOXF2Q12947 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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FOXF2Q12947 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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