Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TROQ12816 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TROQ12816 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TROQ12816 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TROQ12816 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TROQ12816 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TROQ12816 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TROQ12816 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TROQ12816 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TROQ12816 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TROQ12816 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TROQ12816 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TROQ12816 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TROQ12816 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TROQ12816 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TROQ12816 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TROQ12816 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TROQ12816 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TROQ12816 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TROQ12816 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TROQ12816 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TROQ12816 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TROQ12816 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TROQ12816 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TROQ12816 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TROQ12816 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TROQ12816 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TROQ12816 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TROQ12816 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TROQ12816 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TROQ12816 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TROQ12816 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TROQ12816 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TROQ12816 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TROQ12816 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TROQ12816 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TROQ12816 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TROQ12816 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TROQ12816 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TROQ12816 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TROQ12816 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TROQ12816 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TROQ12816 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TROQ12816 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TROQ12816 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TROQ12816 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TROQ12816 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TROQ12816 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TROQ12816 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TROQ12816 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TROQ12816 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TROQ12816 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TROQ12816 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TROQ12816 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TROQ12816 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TROQ12816 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TROQ12816 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TROQ12816 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TROQ12816 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TROQ12816 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TROQ12816 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TROQ12816 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TROQ12816 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TROQ12816 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TROQ12816 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TROQ12816 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TROQ12816 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TROQ12816 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TROQ12816 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TROQ12816 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TROQ12816 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TROQ12816 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TROQ12816 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TROQ12816 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TROQ12816 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TROQ12816 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TROQ12816 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TROQ12816 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TROQ12816 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TROQ12816 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TROQ12816 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TROQ12816 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TROQ12816 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TROQ12816 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TROQ12816 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TROQ12816 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TROQ12816 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TROQ12816 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TROQ12816 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TROQ12816 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TROQ12816 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TROQ12816 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TROQ12816 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TROQ12816 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TROQ12816 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TROQ12816 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TROQ12816 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TROQ12816 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TROQ12816 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TROQ12816 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
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