Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFCP2Q12800 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms