Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCC8Q09428 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCC8Q09428 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms