Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSRP1Q08945 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms