Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms