Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHRNB3Q05901 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms