Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CALD1Q05682 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms