Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms