Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV1Q03135 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms