Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
OTUD4Q01804 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTUD4Q01804 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms