Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MC1RQ01726 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MC1RQ01726 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms