Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2C1P98194 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms