Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBX1P83916 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBX1P83916 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBX1P83916 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBX1P83916 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBX1P83916 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CBX1P83916 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBX1P83916 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBX1P83916 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBX1P83916 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBX1P83916 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBX1P83916 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBX1P83916 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBX1P83916 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX1P83916 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX1P83916 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX1P83916 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX1P83916 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX1P83916 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX1P83916 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX1P83916 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX1P83916 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX1P83916 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX1P83916 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX1P83916 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX1P83916 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX1P83916 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX1P83916 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX1P83916 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX1P83916 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX1P83916 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX1P83916 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX1P83916 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX1P83916 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX1P83916 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX1P83916 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX1P83916 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX1P83916 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX1P83916 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX1P83916 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX1P83916 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX1P83916 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX1P83916 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX1P83916 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX1P83916 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX1P83916 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX1P83916 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX1P83916 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX1P83916 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX1P83916 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX1P83916 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX1P83916 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX1P83916 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX1P83916 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX1P83916 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX1P83916 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX1P83916 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms