Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIM1P81133 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIM1P81133 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SIM1P81133 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIM1P81133 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIM1P81133 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIM1P81133 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIM1P81133 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIM1P81133 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIM1P81133 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIM1P81133 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIM1P81133 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIM1P81133 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIM1P81133 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIM1P81133 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIM1P81133 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIM1P81133 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIM1P81133 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIM1P81133 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIM1P81133 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIM1P81133 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIM1P81133 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms