Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRX1P78414 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRX1P78414 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRX1P78414 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRX1P78414 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRX1P78414 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRX1P78414 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRX1P78414 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRX1P78414 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRX1P78414 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRX1P78414 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRX1P78414 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRX1P78414 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRX1P78414 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRX1P78414 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRX1P78414 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRX1P78414 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRX1P78414 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRX1P78414 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRX1P78414 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRX1P78414 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRX1P78414 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRX1P78414 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IRX1P78414 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRX1P78414 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IRX1P78414 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRX1P78414 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRX1P78414 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRX1P78414 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRX1P78414 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRX1P78414 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRX1P78414 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRX1P78414 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRX1P78414 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRX1P78414 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRX1P78414 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IRX1P78414 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRX1P78414 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRX1P78414 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRX1P78414 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IRX1P78414 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRX1P78414 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRX1P78414 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IRX1P78414 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms