Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHC1P78364 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHC1P78364 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHC1P78364 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHC1P78364 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHC1P78364 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHC1P78364 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHC1P78364 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHC1P78364 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHC1P78364 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHC1P78364 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHC1P78364 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHC1P78364 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PHC1P78364 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHC1P78364 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHC1P78364 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHC1P78364 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PHC1P78364 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHC1P78364 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHC1P78364 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHC1P78364 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHC1P78364 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHC1P78364 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHC1P78364 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHC1P78364 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHC1P78364 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHC1P78364 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHC1P78364 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHC1P78364 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHC1P78364 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHC1P78364 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHC1P78364 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHC1P78364 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHC1P78364 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHC1P78364 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHC1P78364 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHC1P78364 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHC1P78364 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHC1P78364 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PHC1P78364 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHC1P78364 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHC1P78364 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHC1P78364 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHC1P78364 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHC1P78364 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHC1P78364 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHC1P78364 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHC1P78364 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHC1P78364 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHC1P78364 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHC1P78364 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHC1P78364 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHC1P78364 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHC1P78364 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHC1P78364 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHC1P78364 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PHC1P78364 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHC1P78364 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHC1P78364 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHC1P78364 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHC1P78364 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHC1P78364 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHC1P78364 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHC1P78364 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHC1P78364 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHC1P78364 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHC1P78364 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHC1P78364 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHC1P78364 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PHC1P78364 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHC1P78364 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHC1P78364 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHC1P78364 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHC1P78364 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHC1P78364 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHC1P78364 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHC1P78364 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHC1P78364 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHC1P78364 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHC1P78364 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHC1P78364 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHC1P78364 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHC1P78364 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PHC1P78364 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHC1P78364 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PHC1P78364 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHC1P78364 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHC1P78364 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHC1P78364 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHC1P78364 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PHC1P78364 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHC1P78364 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHC1P78364 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHC1P78364 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHC1P78364 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHC1P78364 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHC1P78364 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHC1P78364 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHC1P78364 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHC1P78364 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms