Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P62684 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms