Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ABCE1P61221 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms