Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2FP61218 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms