Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NME5P56597 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NME5P56597 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NME5P56597 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NME5P56597 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NME5P56597 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NME5P56597 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NME5P56597 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NME5P56597 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NME5P56597 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NME5P56597 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NME5P56597 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NME5P56597 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NME5P56597 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NME5P56597 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NME5P56597 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NME5P56597 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NME5P56597 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NME5P56597 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NME5P56597 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NME5P56597 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NME5P56597 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NME5P56597 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NME5P56597 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NME5P56597 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NME5P56597 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NME5P56597 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NME5P56597 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NME5P56597 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NME5P56597 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NME5P56597 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NME5P56597 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NME5P56597 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NME5P56597 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME5P56597 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME5P56597 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME5P56597 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME5P56597 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME5P56597 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME5P56597 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME5P56597 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME5P56597 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME5P56597 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME5P56597 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NME5P56597 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms